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news 2025/7/31 15:07:10
合肥做网站便宜mdyun,网站建站,泰安人才招聘网,淘宝网站SEO怎么做目录 关于umi矩阵学习 用umi计算feature、counts值 ①meta数据查看 ②Count和Feature计算（生成Seurat时自动计算） 1）提取UMI矩阵 2）计算 其他指标 评估质量指标（重点） 1）UMI计数 2）基因计数 3）UMIs vs. genes detected 4）线粒体计数比率 5）综合过滤 过…

目录

关于umi矩阵学习

用umi计算feature、counts值

①meta数据查看

②Count和Feature计算（生成Seurat时自动计算）

1）提取UMI矩阵

2）计算

其他指标

评估质量指标（重点）

1）UMI计数

2）基因计数

3）UMIs vs. genes detected

4）线粒体计数比率

5）综合过滤

过滤提取子集

关于umi矩阵学习

10X数据因为有UMI，不需要考虑基因长度的影响，但仍然需要考虑测序深度在不同细胞之间的差异，所以需要用函数LogNormalize进行处理，具体方法是用该基因的UMI/该细胞的全部UMI，再乘以10000，在按列LogNormalize后，又可以按行进行scale​​，以去除极大值极小值基因对数据的影响。关于单细胞TPM、Count数据的处理_rds文件的umicount和readcount是什么-CSDN博客

用umi计算feature、counts值

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①meta数据查看


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